So bedeutend der „Große Trek“ für die Zukunft Südafrikas war, die Kapkolonie selbst wurde davon zunächst nur in geringem Maße beeinflusst. Die Buren hingegen bildeten eigene unabhängige Republiken, von denen die größten der 1854 gegründete Oranje-Freistaat und die 1853 ausgerufene Südafrikanische Republik waren. Die 1886 entdeckten Goldfelder am Witwatersrand zogen in der Südafrikanischen Republik ein ungeahntes Wirtschaftswachstum nach sich und damit auch den Zuzug einer sehr hohen Zahl an Ausländern und Gastarbeitern.
In den Problemen, die aus der Überfremdung des Landes entstanden und der verstärkten antibritisch ausgerichteten Politik des Präsidenten der Südafrikanischen Republik, Paul „Ohm“ Kruger, erblickte der damalige Premierminister der Kapkolonie Cecil John Rhodes eine günstige Gelegenheit, alte Pläne für ein vereintes britisches Südafrika wieder aufleben zu lassen, die Burenrepublik Transvaal zu annektieren sowie die 1867 entdeckten Diamantenvorkommen selbst abzubauen. Dabei setzte er voll und ganz auf die Unzufriedenheit der in Transvaal lebenden (zumeist weißen) Ausländer, die sich von den Buren als Menschen zweiter Klasse behandelt fühlten. Die Folge war 1880 der Erste Englisch-Burische Krieg, den die Buren aufgrund ihrer Guerillataktik gewinnen konnten.
Ein gescheiterter Putschversuch der Regierung in Pretoria durchCecil Rhodes förderte zusätzlich das Zusammengehörigkeitsgefühl und den Widerstand aller Buren. Verbale Angriffe zwischen dem 1897 zum Gouverneur der Kapprovinz ernannten Sir Alfred Milner und Paul Kruger sowie wechselseitige Forderungen und Ultimaten eskalierten zum Zweiten Englisch-Burischen Krieg (1899–1902). Den Engländern gelang es jedoch nicht, die zahlenmäßig unterlegenen Buren, die immer wieder in kleinen Guerillakommandos angriffen, rasch zu besiegen. Der Befehlshaber der Briten ließ daraufhin die burischen Farmen niederbrennen (Taktik der „verbrannten Erde“), wodurch er dem Feind allmählich die Lebensgrundlagen entzog. Außerdem errichtete er kilometerlange Blockhausketten, die, durch Stacheldraht miteinander verbunden, ständig vorgeschoben wurden.
Konzentrationslagern
Die heimatlos gewordenen Frauen und Kinder fasste man in riesigen Konzentrationslagern zusammen. Schlechte Ernährung, mangelnde Hygiene und unzureichende ärztliche Betreuung führten zu Krankheiten und Epidemien, die bis zum Ende des Krieges rund 25.000 Frauen und Kinder das Leben kostete. Kapstadt war nicht direkt in den Konflikt involviert, doch die Spannungen zwischen Briten und Afrikaanern wuchsen. Bis heute spielt dieser vermeintliche Sieg der Engländer eine Rolle im Umgang zwischen Briten und Buren.
Durch die Niederlage wurden die beiden ehemaligen Burenrepubliken zu britischen Kronkolonien, was zugleich bedeutete, dass das gesamte südliche Afrika unter britischer Oberherrschaft stand. Der Sieg der Liberalen Partei in Großbritannien Ende 1905 führte zu einer Politik der Versöhnung und Verständigung zwischen Buren und Briten. Verhandlungen führten schließlich dazu, dass 1906 Transvaal und 1907 die Oranje-Kolonie die innere Selbstverwaltung erhielten. Neben den vier Kolonien (Kapkolonie, Natal, Transvaal, Oranje-Freistaat) gab es zu Beginn des 20. Jahrhunderts die Hochkommissariate Basutoland, Betschuanaland und Swaziland, außerdem Südrhodesien (das heutige Zimbabwe).
Ein gescheiterter Putschversuch der Regierung in Pretoria durch Cecil Rhodes förderte zusätzlich das Zusammengehörigkeitsgefühl und den Widerstand aller Buren. Verbale Angriffe zwischen dem 1897 zum Gouverneur der Kapprovinz ernannten Sir Alfred Milner und Paul Kruger sowie wechselseitige Forderungen und Ultimaten eskalierten zum Zweiten Englisch-Burischen Krieg (1899–1902). Den Engländern gelang es jedoch nicht, die zahlenmäßig unterlegenen Buren, die immer wieder in kleinen Guerillakommandos angriffen, rasch zu besiegen. Der Befehlshaber der Briten ließ daraufhin die burischen Farmen niederbrennen (Taktik der „verbrannten Erde“), wodurch er dem Feind allmählich die Lebensgrundlagen entzog. Außerdem errichtete er kilometerlange Blockhausketten, die, durch Stacheldraht miteinander verbunden, ständig vorgeschoben wurden.